Лабораторная диагностика инвазивных форм аспергиллеза

• Грибкова Ольга Витальевна
• Ерещенко Алена Анатольевна
• Янченко Анна Витальевна

Резюме

Инвазивный аспергиллез является тяжелым микозом с преимущественным поражением бронхолегочной системы, отличается высокой летальностью, особенно среди иммунокомпрометированных пациентов. Гематогенная диссеминация аспергилл приводит к поражению различных органов и систем. Ранняя диагностика аспергиллеза важна для своевременного начала лечения и улучшения прогноза.

Цель - сравнительный анализ лабораторных методов диагностики инвазивного аспергиллеза.

Материал и методы. Поиск статей проведен в базах данных PubMed, Elsevier, Scopus, Google Scholar, eLIBRARY за период с 2003 по 2024 г. Ключевые слова для отбора статей: аспергиллез, культуральные методы, гистологическое исследование, полимеразная цепная реакция, масс-спектрометрия, секвенирование, галактоманнан, (1-3)-β-D-глюкан.

Заключение. Методы "золотого стандарта" (культуральное и гистологическое исследование) дополняются культурально-независимыми (полимеразная цепная реакция, масс-спектрометрия, секвенирование и др.), позволяющими расширить спектр идентифицируемых патогенов и выявить их лекарственную резистентность.

Ключевые слова: аспергиллез; культуральные методы; полимеразная цепная реакция; масс-спектрометрия; секвенирование; галактоманнан; (1-3)-β-D-глюкан

Виды рода Aspergillus повсеместно встречаются в окружающей среде [1, 2]. Некоторые из них могут вызывать заболевание человека, чаще всего у иммунокомпрометированных людей с сопутствующими заболеваниями [3, 4]. Чаще всего аспергиллез вызывают Aspergillus fumigatus, A. flavus, A. niger и A. terreus [2, 5, 6]. Поражения, вызываемые представителями рода Aspergillus, разделяют на инвазивные, сапрофитические и аллергические [6, 7]. Инвазивный аспергиллез (ИА) чаще всего развивается в бронхолегочной системе [8], однако гематогенное распространение возбудителя из первичного очага может приводить к поражению других органов [6, 8]. Верификация аспергиллеза у пациентов, его дифференциальная диагностика с другими патологиями является сложной клинико-диагностической задачей, решение которой невозможно без использования методов целенаправленной лабораторной диагностики. В арсенале лабораторной службы имеется несколько методов, обеспечивающих решение данной задачи, описанию и анализу которых и посвящен систематизированный аналитический обзор.

Цель - сравнительный анализ лабораторных методов диагностики инвазивного аспергиллеза.

Материал и методы

Поиск статей проведен в базах данных PubMed, Elsevier, Scopus, Google Scholar, eLIBRARY с 2003 по 2024 г. по следую­щим ключевым словам: аспергиллез, культуральные методы, гистологическое исследование, полимеразная цепная реакция (ПЦР), масс-спектрометрия, секвенирование, галактоманнан, (1-3)-β-D-глюкан. Из 98 найденных источников для обзора было отобрано 71.

Результаты

Распространенность аспергиллеза в клинической практике

Случаи инвазивного аспергиллеза могут встречаться в офтальмологической и оториноларингологической практике. Аспергиллезные кератиты и эндофтальмиты зачастую приводят к необратимой потере зрения [9]. Широкое распространение оперативных вмешательств на роговице является дополнительным фактором риска микотического поражения глаз [10]. Аспергиллезные поражения ЛОР-органов все чаще встречаются в виде спорадических случаев во многих странах, в том числе в России. [11, 12]. Аспергиллез околоносовых пазух и наружного слухового прохода является частым осложнением на фоне онкогематологических заболеваний, а также опухолевых процессов и хронических синуситов [12, 13].

Отмечена тенденция роста регистрируемых случаев поражения центральной нервной системы (ЦНС), вызванного Aspergillus spp. [14]. Подобные состояния, как правило, являются проявлениями диссеминации возбудителя, входными воротами для которого могут быть придаточные пазухи носа, орбита [15]. Микотическая инвазия может произойти в результате черепно-мозговых травм и нейрохирургических вмешательств [16, 17].

В период пандемии COVID-19 стало накапливаться все больше данных о случаях вторичных инвазивных аспергиллезов ЦНС, развивающихся у госпитализированных пациентов с COVID-19, в том числе после выписки из стационара [15]. В научной литературе имеются единичные описания случаев инвазивного микотического поражения данного типа у пациентов без подтвержденной иммуносупрессии [14]. В основе механизмов деструктивного действия грибов Aspergillus на структуры ЦНС - продукция некротических факторов, способных оказывать токсическое воздействие на клетки нервной системы, что в итоге приводит к их лизису [16]. Летальность при инвазивном аспергиллезе ЦНС достигает 99% [18].

Основной проблемой диагностики является неспецифичность клинических проявлений микотической инвазии, зачастую диагноз аспергиллеза ставят посмертно при проведении патогистологического исследования.

В структуре инвазивных аспергиллезов выделяют поражения опорно-двигательной системы [19]. Среди так называемых специфических спондилитов аспергиллезные спондилиты являются одними из самых сложных с точки зрения этиологической верификации диагноза [20], поскольку течение заболевания схоже с клинической картиной туберкулезного спондилита [21]. Подобная патология может иметь в том числе и рецидивирующее течение [21].

Аспергиллезные поражения в гастроэнтерологии еще несколько лет назад считались казуистикой, однако врачи данной и смежных специальностей все чаще стали сталкиваться с данной патологией. Поражение органов желудочно-кишечного тракта (ЖКТ) чаще всего является результатом диссеминации аспергилл при наличии первичного легочного очага. Внелегочными первичными очагами инфекции могут быть печень, селезенка, кишечник и пищевод, которые проявляются в виде изолированных форм аспергиллеза ЖКТ [22]. Имеются случаи аспергиллеза гепатобилиарной системы. Цирроз печени и печеночная недостаточность нередко являются фоновым состоянием для развития диссеминированного аспергиллеза [23, 24]. Описаны случаи аспергиллезного холангита и сочетанные поражения печени грибами рода Aspergillus и эхинококка [25, 26].

В хирургической практике у больных с ожогами встречаются поражения кожи Aspergillus spp. Аспергиллез может развиться вследствие загрязнения раны или места пункции/инъекции, ожоговой поверхности, иметь катетер-ассоциированный характер [27, 28], что служит проявлением инфекции, связанной с оказанием медицинской помощи при проведении пластических операций [29]. Случаи инвазивного аспергиллеза встречаются в практике акушеров-гинекологов [30, 31], урологов [32] и эндокринологов [33].

Наиболее опасной клинической формой аспергиллеза является инвазивный аспергиллез легких (ИАЛ), приводящий к летальному исходу у пациентов с ослабленным иммунитетом и в критическом состоянии. Выживаемость заболевших зависит от ранней диагностики и своевременного начала терапевтических мероприятий. Однако диагноз аспергиллеза устанавливают редко, поскольку посев крови недостаточно чувствителен при этом заболевании, а для получения гистологических данных необходимо проведение инвазивных процедур. Диагностика заболевания может усложняться из-за неспецифичности клинических проявлений [34, 35]. Ведение пациентов с аспергиллезом легких затруднено ограниченностью схем лечения, нежелательными явлениями в ходе терапии и возникновением резистентности к противомикотическим препаратам [36]. Поэтому предпринимаются усилия по разработке надежных, быстрых и неинвазивных методов диагностики данного заболевания.

ИАЛ может появиться на фоне длительного применения иммуносупрессивной терапии после трансплантации гемопоэтических стволовых клеток (ТГСК) или солидных органов, лечения онкологических заболеваний, тяжелой нейтропении, лечения глюкокортикоидами, на фоне СПИДа, хронической обструктивной болезни легких, муковисцидоза, туберкулеза, цирроза печени, сахарного диабета, врожденных иммунологических дефектов и др. [13, 37]. Вирусная пневмония повышает восприимчивость пациентов к бактериальным и микотическим суперинфекциям, включая инвазивный аспергиллез легких, что сопровождается повышением летальности [34, 35, 38-40].

Лабораторная диагностика аспергиллеза

Общепринятый подход в диагностике аспергиллеза легких основан на учете факторов риска инфицирования и развития инфекционного процесса, выявлении клинических симптомов, анализе рентгенологических особенностей и результатов гистопатологического исследования, выделении чистой культуры Aspergillus spp. [36, 41]. Биологический материал для диагностики аспергиллеза легких - биоптат ткани легкого, бронхоальвеолярный лаваж (БАЛ), небронхоскопический лаваж, аспират трахеи, мокрота, плазма, сыворотка крови и другие биологические жидкости, исследование которых имеют разную степень информативности и ограничения, в том числе при взятии материала [40, 42, 43].

Диагностика аспергиллеза может осложняться трудностью взятия образцов тканей, отсутствием типичных клинических и рентгенологических проявлений инфекционного процесса [44, 45]. Например, у пациентов с предполагаемым аспергиллезом легких, ассоциированным с COVID-19, могут отсутствовать типичные рентгенологические признаки. Поражения, которые могли бы указывать на ИАЛ, бывают скрыты или имитироваться поражением легких у пациентов с тяжелой формой COVID-19.

Интерпретация результатов культурального исследования проб нестерильных жидкостей (мокроты, аспирата трахеи и др.) затруднена, поскольку выделение грибов Aspergillus spp. не позволяет дифференцировать носительство от инвазивной формы заболевания, вызванного аспергиллами.

Диагноз ИАЛ может быть верифицирован с помощью гистологического исследования. Однако получение образцов для гистологии путем биопсии инфицированной ткани часто невозможно, например из-за наличия противопоказаний: нестабильности гемодинамики, коагулопатии, нахождения пациента на искусственной вентиляции легких [34, 40, 46].

Рутинные диагностические тесты, используемые для диагностики аспергиллеза, имеют свои ограничения: например, микологическое исследование биологического материала требует длительного времени, а прямая микроскопия характеризуется низкой чувствительностью и специфичностью.

В практике здравоохранения для верификации диагноза инвазивной формы аспергиллеза применяют совокупность методов: рентгенологический, бактериологический, микроскопический, иммуноферментный анализ (ИФА), иммунохроматографический тест бокового потока (LFT)¹, полимеразную цепную реакцию (ПЦР) [36, 40, 41, 47, 48].

¹ Тест бокового потока (LFT) также известен как устройство бокового потока (LFD) или иммунохроматографический анализ бокового потока. - Примеч. научн. ред.

Для ранней инструментальной диагностики ИАЛ используют компьютерную томографию (КТ) грудной клетки. Наиболее характерными результатами КТ при ИАЛ являются ореол затухания "матового стекла" вокруг очаговых узелков и образование "воздушного полумесяца". Оба признака относительно специфичны для ИАЛ у пациентов с фебрильной нейтропенией, но сообщалось также об их связи с целым рядом других заболеваний [49, 50]. Относительно специфические признаки на КТ-снимках отмечаются недолго, до 7-14 дней [47]. Таким образом, невозможно установить точный диагноз ИАЛ только на основании результатов КТ грудной клетки.

"Золотой стандарт" диагностики аспергиллеза - культуральное исследование и микроскопия тканей (гистопатология) [40]. Бактериологический метод исследования образцов клинического материала от пациентов с подозрением на инвазивный аспергиллез является простой, незатратной, технически выполнимой процедурой, которая позволяет идентифицировать виды Aspergillus и определить их чувствительность к антимикотическим препаратам. Однако только у 50-60% пациентов с инвазивным аспергиллезом диагноз подтверждают получением культуры возбудителя. Культуральное исследование длительное, и часто положительный результат приходит только на поздних стадиях заболевания.

Обнаружение грибов рода Aspergillus в образцах из нижних дыхательных путей, выделение Aspergillus из мокроты и бронхиального секрета у пациентов с клиническим подозрением на заболевание указывает на инвазивный аспергиллез. Выделение Aspergillus из тканевых образцов также может быть полезно для диагностики, особенно если образцы были получены с использованием процедуры, гарантирующей стерильность сбора материала [42].

В исследовании J. Sinkо и соавт. [51] установлено, что с помощью культурального метода прижизненно было идентифицировано меньше половины случаев инвазивных микотических инфекций, далее подтвержденных при аутопсии. Частота выделения культуры Aspergillus spp. из образцов тканей при аутопсии невысока, что является главным недостатком этого метода [52, 53].

Использование матрично-активированной лазерной десорбционно-ионизационной времяпролетной масс-спектрометрии (MALDI-TOF MS - Matrix-Assisted Lazer Desorption/Ionization Time-of-Flight Mass Spectrometry), обладающей высокой надежностью, чувствительностью и воспроизводимостью, позволило повысить частоту идентификации клинически значимых нитчатых грибов от 64 до 99% [54-56].

Технология MALDI-TOF MS применяется для межвидовой идентификации аспергилл, тестирования их устойчивости к антимикотическим препаратам в биологическом материале [56].

К трудностям лабораторной диагностики аспергиллеза методом MALDI-TOF MS можно отнести отсутствие стандартизации обработки биологических проб и самого процесса исследования, включая параметры сбора данных, качество матрицы, аппаратное обеспечение и высокую стоимость самого оборудования. Одно из главных ограничений - недостаточный охват видов грибов в коммерческих базах данных, предоставляемых производителями систем MALDI-TOF MS [57, 54]. Поэтому данную технологию применяют совместно с другими методами.

Для ранней диагностики ИАЛ рекомендуют использовать обнаружение антигенов аспергилл - галактоманнана и (1-3)-β-D-глюкана [47]. Обнаружение галактоманнана (ГМ) в БАЛ у пациентов с риском развития ИАЛ имеет значимую диагностическую точность, поскольку он раньше и в более высоких концентрациях появляется в БАЛ по сравнению с сывороткой крови [58]. Тестирование образцов сыворотки крови на ГМ имеет ограниченную чувствительность в диагностике ИАЛ у пациентов без нейтропении. Следует учитывать воздействие активных против плесневых грибов антимикотических препаратов, снижающих результативность данного теста [59].

ГМ определяют методом ИФА, иммунохроматографическим анализом бокового потока (LFA) или с применением устройств для считывания бокового потока (LFD) [48].

При тестировании небронхоскопического лаважа или БАЛ у 23 пациентов с предполагаемым диагнозом ИАЛ, ассоциированным с COVID-19, полученные с помощью LFA и LFD результаты на ГМ соответствовали результатам ИФА (κ=0,702) [39]. LFA прост, может проводиться как в учреждениях 3‑го уровня изоляции, так и за пределами специализированных микологических центров [40].

Обнаружение ГМ в БАЛ указывает на наличие ИАЛ, а определение ГМ в БАЛ у пациентов ОРИТ с COVID-19-ассо­циированным ИАЛ (84%) значительно превышало чувствительность микологических методов (21-36%) [44]. Выявление ГМ в БАЛ является основным тестом для диагностики вторичного ИАЛ у пациентов с тяжелым течением COVID-19 [58]. Обнаружение ГМ в БАЛ не доказывает инвазию тканей, и вероятность наличия инфекции повышается при обнаружении циркулирующего в сыворотке крови ГМ. Однако диагностический эффект сывороточного ГМ при ИАЛ, ассоциированном с COVID-19, низок, поскольку в лучшем случае у 20% пациентов с ИАЛ были получены положительные результаты и сообщалось о доказанных случаях ИАЛ с отрицательным уровнем сывороточного ГМ. В целом определение сывороточного ГМ имеет пониженную ценность для исключения ИАЛ, ассоциированного с COVID-19 [40].

Наряду с ГМ для скрининга сыворотки крови на ИАЛ используют еще один биомаркер - (1-3)-β-D-глюкан. Исследование, не связанное с COVID-19, показало, что два последовательных положительных результата теста на сывороточный (1-3)-β-D-глюкан дают специфичность 90%. Следовательно, два последовательных положительных результата на сывороточный (1-3)-β-D-глюкан могут усилить подозрение на наличие инвазивного аспергиллеза, хотя (1-3)-β-D-глюкан не специфичен для аспергиллеза, и необходимо исключить другие причины повышенной концентрации (1-3)-β-D-глюкана в сыворотке крови [42, 40]. Тесты на ГМ и (1-3)-β-D-глюкан положительны только на поздних стадиях ИAЛ у большинства пациентов.

В 2019 г. в официальном руководстве по клинической практике Американского торакального общества было рекомендовано использовать метод ПЦР с сывороткой крови, БАЛ для постановки диагноза при подозрении на ИАЛ у пациентов с ослабленным иммунитетом [60]. В 2020 г. метод ПЦР на аспергиллез с биологическим материалом пациента (биоптат легкого, БАЛ, сыворотка крови, плазма крови и др.) был включен в европейские рекомендации по диагностике микозов с требованием наличия двух положительных результатов и более, обеспечивающих достаточную специфичность для подтверждения диагноза [41].

Рабочая группа Международного общества микологии человека и животных "Инициатива по ПЦР грибов" в многоцентровом исследовании подтвердила аналитическую валидность и умеренную диагностическую точность метода ПЦР при использовании в качестве скрининговых тестов на инвазивный аспергиллез в группах пациентов высокого риска. Ею было продемонстрировано, что эффективность ПЦР для обнаружения ДНК возбудителей аспергиллеза ограничена процедурой экстракции ДНК, а не амплификацией в ПЦР. В итоге были предложены методические рекомендации для разработки и стандартизации этого метода для указанных целей [61].

Метод ПЦР для выявления ДНК рода Aspergillus подразделяют на 3 основные категории: 1) тесты in house, так называемые домашние лабораторные тесты, разрабатываемые отдельными клиническими микробиологическими лабораториями для обнаружения ДНК рода Aspergillus; 2) коммерческие наборы на Aspergillus spp., предоставляемые различными биотехнологическими компаниями, и 3) коммерческие платформы мультиплексной ПЦР для обнаружения множества потенциально патогенных организмов, включая виды рода Aspergillus. В качестве мишеней для ПЦР используются генетические последовательности 18s рРНК, 28s рРНК, 18s рДНК, 5.8S рДНК, 28s рДНК, митохондриальная ДНК и внутренние транскрибируемые спейсерные области (ITS-1 и ITS-2) [62]. Важно отметить, что чувствительность теста обеспечивает высокую отрицательную прогностическую ценность, так что отрицательный тест позволяет исключить диагноз. Последовательные положительные результаты показывают хорошую специфичность в диагностике инвазивного аспергиллеза и могут быть использованы для запуска рентгенологических и других исследований или для превентивной терапии при отсутствии специфических рентгенологических признаков при высоком клиническом подозрении на инфекцию [63].

Значимость ПЦР в диагностике ИАЛ заметно повышается при его комбинировании с другими диагностическими тестами - определением ГМ в сыворотке крови и БАЛ [64].

Благодаря повышенной чувствительности метод ПЦР позволяет определить не только род возбудителя (Aspergillus spp.), но и его виды, которые колонизируют дыхательные пути. Исследование БАЛ методом ПЦР обеспечивает специфичность, аналогичную тестированию на ГМ [42]. При наличии клинических или рентгенологических признаков, типичных для ИАЛ, единичный положительный ПЦР-результат в БАЛ из инфицированной доли указывает на ИАЛ, и тестирование на ГМ обычно подтверждает диагноз [40].

ПЦР на Aspergillus spp., устройства для считывания бокового потока и ГM-тесты являются наиболее полезными методами диагностики заболевания с использованием образцов БАЛ [53].

Установлено, что чувствительность исследования образцов сыворотки крови методом ПЦР значительно ниже, чем образцов, полученных из дыхательных путей [43]. Некоторые данные указывают на более низкую чувствительность ПЦР у пациентов, получавших антимикотические препараты с профилактической или лечебной целью. Поскольку тест на ГМ и ПЦР выявляют различные маркеры аспергилл, их комбинирование, вероятно, более полезно для повышения эффективности диагностики аспергиллеза и мониторинга заболевания [63, 64].

В России в практике здравоохранения имеются валидизированные ПЦР-наборы для обнаружения ДНК грибов рода Aspergillus. Разработана экспериментальная мультиплексная ПЦР тест-система HRM-Zygo-Asp для одновременного определения ДНК грибов рода Aspergillus и/или порядка Mucoralis [65], а также ПЦР-наборы для определения ДНК наиболее распространенных видов A. fumigatus/A. flavus, A. terreus/A. niger.

В качестве дополнения к рутинному микологическому тесту в диагностике инфекции, вызванной грибами рода Aspergillus, рядом исследователей предложено метагеномное секвенирование нового поколения (mNGS) - специфичный метод с высокой прогностическую ценностью в отношении определения Aspergillus spp. в БАЛ [66, 67].

Амплификацию и секвенирование ДНК все чаще используют для лабораторной диагностики микозов, что позволяет выявлять все патогенные микроорганизмы, особенно при первоначальном отрицательном результате микробиологического исследования и в случаях с низкой микотической нагрузкой [68].

X. Fang и соавт. [69] провели сравнение диагностической эффективности традиционных методов исследования и метагеномного секвенирования нового поколения (mNGS) по выявлению патогенных микроорганизмов в БАЛ у пациентов с ИВЛ-ассоциированной пневмонией. Метод mNGS продемонстрировал преимущества в одновременном обнаружении бактерий, грибов, вирусов и идентификации возбудителей при сочетанных инфекциях.

Однако mNGS и традиционные методы в нескольких случаях дали противоречивые результаты в отношении обнаружения грибов. Поэтому авторы исследования обращают внимание на то, что интерпретация данных mNGS должна сочетаться с результатами других методов и учитывать клинические данные. В исследовании K. Zhang и соавт. [70] применение mNGS позволило выявить в БАЛ у пациента с тяжелой пневмонией сочетанную инфекцию, вызванную тремя видами грибов, при отсутствии положительных результатов посева крови, мокроты, тестов на ГМ и (1-3)-β-D-глюкан.

J. Chen и соавт. [71] подчеркивают полезность mNGS в качестве метода быстрого одновременного выявления патогенов как в БАЛ, так и в образцах сыворотки крови пациентов с тяжелой пневмонией. Z. Ao и соавт. [66] показали, что mNGS имеет сопоставимую с культуральным методом специфичность при обнаружении грибов рода Aspergillus. Несмотря на то что чувствительность mNGS ниже, чем у теста на ГМ, mNGS более чувствительный метод, чем мазок, и более специфичен, чем тест на ГМ в сыворотке крови и в БАЛ. Поэтому mNGS рассматривается в качестве некультурального теста для выявления представителей рода Aspergillus, дополнительного к рутинному микробиологическому тесту и КТ легких. Использование этого метода для диагностики ИАЛ ограничено отсутствием единого стандарта клинической интерпретации результатов обнаружения аспергилл с помощью mNGS, трудностью в определении пороговых значений обнаружения, дороговизной оборудования для секвенирования, высокими требованиями к квалификации сотрудников. Кроме того, не существует единых диагностических критериев ИАЛ на основе обнаружения Aspergillus с помощью mNGS для пациентов без иммунодефицита [67].

Заключение

Несмотря на то что методы "золотого стандарта" (культуральное и гистологическое исследование) продолжают играть центральную роль в диагностике микозов, про-изошел значительный сдвиг в сторону использования других методов исследования (ПЦР, масс-спектрометрия, секвенирование ДНК и др.). Применение этих методов значительно расширило спектр идентифицируемых патогенов и позволило выявлять их лекарственную резистентность, увеличило скорость обработки биологического материала и пропускную способность лаборатории.

Литература

1. Kwon-Chung K.J., Sugui J.A. Aspergillus fumigatus - what makes the species a ubiquitous human fungal pathogen? // PLoS Pathog. 2013. Vol. 9, N 12. Article ID e1003743. DOI: https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1003743
2. Paulussen C., Hallsworth J.E., Álvarez-Pérez S. et al. Ecology of aspergillosis: insights into the pathogenic potency of Aspergillus fumigatus and some other Aspergillus species // Microb. Biotechnol. 2017. Vol. 10, N 2. P. 296-322. DOI: https://doi.org/10.1111/1751-7915.12367
3. Cadena J., Thompson G.R. 3rd, Patterson T.F. Aspergillosis: epidemiology, diagnosis, and treatment // Infect. Dis. Clin. North Am. 2021. Vol. 35, N 2. P. 415-434. DOI: https://doi.org/10.1016/j.idc.2021.03.008
4. Machado M., Fortún J., Muñoz P. Invasive aspergillosis: a comprehensive review // Med. Clin. (Barc.). 2024. Vol. 163, N 4. P. 189-198. DOI: https://doi.org/10.1016/j.medcli.2024.01.045
5. Sugui J.A., Kwon-Chung K.J., Juvvadi P.R. et al. Aspergillus fumigatus and related species // Cold Spring Harb. Perspect. Med. 2014. Vol. 5, N 2. Article ID a019786. DOI: https://doi.org/10.1101/cshperspect.a019786
6. Масчан А.А., Клясова Г.А., Веселов А.В. Обзор рекомендаций Американского общества по инфекционным болезням по лечению аспергиллеза // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. Т. 10, № 2. С. 96-142.
7. Al-Alawi A., Ryan C.F., Flint J.D. et al. Aspergillus-related lung disea­se // Can. Respir. J. 2005. Vol. 12, N 7. P. 377-387. DOI: https://doi.org/10.1155/2005/759070
8. Deigendesch N., Nunes J.C., Stenzel W. Handbook of Clinical Neurology. Chapter 18. Parasitic and Fungal Infections. 2018. Vol. 145. P. 245-262. DOI: https://doi.org/10.1016/B978-0-12-802395-2.00018-3
9. Хостелиди С.Н., Харитонова Н.Н., Шадривова О.В. и др. Микотический эндофтальмит (описание клинического случая и обзор литературы) // Проблемы медицинской микологии. 2023. Т. 25, № 4. С. 29-38. DOI: https://doi.org/10.24412/1999-6780-2023-4-29-38
10. Давлетшина Н.И., Самойлов А.Н. Эпидемиология и методы лечения грибковых кератитов // Вестник офтальмологии. Т. 136, № 4. С. 138-145. DOI: https://doi.org/10.17116/oftalma2020136041138
11. Hafrén L., Saarinen R., Kurimo R. et al. Aspergillus sinusitis: risk factors and phenotyping // J. Clin. Med. 2024. 13, N 9. P. 2579. DOI: https://doi.org/10.3390/jcm13092579
12. Крюков А.И., Кунельская В.Я., Шадрин Г.Б. Микотические поражения ЛОР органов // Лечебное дело. 2011. № 3. С. 10-16.
13. Климко Н.Н., Шадривова О.В., Хостелиди С.Н. и др. Инвазивный аспергиллез: результаты многоцентрового исследования // Онкогематология. 2014. Т. 9, № 2. С. 13-19.
14. Вербах Т.Э., Кичерова О.А., Рейхерт Л.И. и др. Аспергиллез головного мозга: трудности диагностики. Клинический случай // Клиническая практика. 2022. Т. 13, № 4. С. 88-92. DOI: https://doi.org/10.17816/clinpract107997
15. Бусалаева Е.И., Башкова И.Б., Максимов Р.С., и др. Аспергиллез головного мозга как осложнение новой коронавирусной инфекции (COVID-19) (клиническое наблюдение) // Русский медицинский журнал. 2023. № 2. С. 77-82.
16. Воеводкина А.Ю., Хайтович А.Б. Аспергиллез центральной нервной системы // Успехи медицинской микологии. № 20. С. 381-385.
17. Gonzales Zamora J.A., Henry Z., Gultekin S.H. Central nervous system Aspergillosis: an unexpected complication following neurosurgery // Diseases. Vol. 6, N 2. P. 46. DOI: https://doi.org/10.3390/diseases6020046
18. Хостелиди C.Н., Борзова Ю.В., Десятик Е.А. и др. Аспергиллез головного мозга: описание четырех клинических случаев // Проблемы медицинской микологии. 2009. Т. 11, № 3. С. 16-19.
19. Макогонова М.Е., Малетин А.С., Десятик Е.А. и др. Инвазивный аспергиллез у подростка // Туберкулез и болезни легких. 2017. Т. 95, № 3. С. 55-61. DOI: https://doi.org/10.21292/2075-1230-2017-95-3-55-61
20. Мамытов М.М., Акматалиев А.А., Исаев Э.К. и др. Аспергиллез позвоночного канала пояснично-крестцового отдела позвоночника (случай из практики) // Вестник Кыргызстана. 2021. № 1-2. С. 161-167. DOI: https://doi.org/10.33514/BK-1694-7711-2021-1(2)-161-167
21. Наумов Д.Г., Вишневский А.А., Карпушин А.А. и др. Аспергиллез позвоночника: редкое клиническое наблюдение и обзор литературы // Хирургия позвоночника. 2023. Т. 20, № 2. С. 65-72. DOI: https://doi.org/10.14531/ss2023.2.65-72
22. Шадривова О.В., Шевяков М.А., Десятик Е.А. и др. Инвазивный аспергиллез пищеварительного тракта // Успехи медицинской микологии. № 17. С. 363-365.
23. Falcone M., Massetti A.P., Russo A. et al. Invasive aspergillosis in patients with liver disease // Med. Mycol. 2011. Vol. 49, N 4. P. 406-413. DOI: https://doi.org/10.3109/13693786.2010.535030
24. Хостелиди С.Н., Шадривова О.В., Шагдилеева Е.В. и др. Случай инвазивного аспергиллеза легких у больного хроническим аутоиммунным гепатитом // Проблемы медицинской микологии. № 3. С. 15-20. DOI: https://doi.org/10.24412/1999-6780-2020-3-15-20
25. Rothe K., Rasch S., Wantia N. et al. Aspergillus fumigatus cholangitis in a patient with cholangiocarcinoma: case report and review of the literature // Infection. 2021. Vol. 49, N 1. P. 159-164. DOI: https://doi.org/10.1007/s15010-020-01487-4
26. Нишонов Ф.Н., Усмонов У.Д., Отакузиев А.З. и др. Сочетанное поражение печени: эхинококкоз и аспергиллез. // Вестник экспериментальной и клинической хирургии. Т. 14, № 1. С. 10-18. DOI: https://doi.org/10.18499/2070-478X-2021-14-1-10-18
27. Kerl K., Koch B., Fegeler W. et al. Catheter-associated aspergillosis of the chest wall following allogeneic hematopoietic stem cell transplantation // Transpl. Infect. Dis. 2011. Vol. 13, N 2. P. 182-185. DOI: https://doi.org/10.1111/j.1399-3062.2010.00559.x
28. Kaur I., de St Maurice A. Catheter-related Aspergillus fungemia: case report and literature review // Pediatr. Infect. Dis. J. 2023. Vol. 42, N 8. P. e308-e311. DOI: https://doi.org/10.1097/INF.0000000000003942
29. Оболенский В.Н., Бурова С.А., Чапарьян Б.А. и др. Смешанный плесневый микоз кожи и мягких тканей ягодичных областей как осложнение пластической операции липофилинга у иммунокомпетентной пациентки молодого возраста (клинический случай и обзор литературы) // Клиническая и экспериментальная хирургия. Журнал имени академика Б.В. Петровского. 2023. Т. 11, № 3. С. 149-160. DOI: https://doi.org/10.33029/2308-1198-2023-11-3-149-160
30. Роша Л.Г., Литвиненко М.В. Аспергиллез в практике патоморфолога // Проблемы медицинской микологии. 2009. Т. 11, № 4. С. 17-20.
31. Шляпников М.Е., Хуторская Н.Н., Кругова Л.В. Диссеминированный висцеральный сочетанный микоз у родильницы с преэклампсией, осложнившейся HELLP-синдромом // Вопросы гинекологии, акушерства и перинатологии. Т. 14, № 1. С. 75-77.
32. Toledo M.G., Alves H.R., Cambruzzi I. et al. Urinary Aspergillosis in a patient with Systemic Lupus Erythematosus (SLE) // Case Rep. Infect. Dis. 2023. Vol. 2023, N 1. P. 1-4. DOI: https://doi.org/10.1155/2023/5575300
33. Богданов А.Н., Семелев В.Н., Тараканова Л.А. и др. Случай диссеминированного инвазивного аспергиллеза у больного острым лейкозом со смешанным фенотипом и нейролейкозом // Проблемы медицинской микологии. 2015. Т. 17, № 2. С. 12-14.
34. Гусаров В.Г., Замятин М.Н., Камышова Д.А. и др. Инвазивный аспергиллез легких у больных COVID-19. // Журнал инфектологии. Т. 13, № 1. С. 38-49. DOI: https://doi.org/10.22625/2072-6732-2021-13-1-38-49
35. Ergün M., Brüggemann R.J.M, Alanio A. et al. Aspergillus test profiles and mortality in critically ill COVID-19 patients // J. Clin. Microbiol. 2021. Vol. 59, N 12. P. 1-11. DOI: https://doi.org/10.1128/JCM.01229-21
36. Lamoth F., Calandra T. Pulmonary aspergillosis: diagnosis and treatment // Eur. Respir. Rev. 2022. Vol. 31, N 166. P. 1-15. DOI: https://doi.org/10.1183/16000617.0114-2022
37. Горяинова А.В., Каширская Н.Ю., Шумилов П.В. и др. Общие рекомендации по диагностике и лечению различных форм легочного аспергиллеза у пациентов с муковисцидозом // Педиатрия. Журнал имени Г.Н. Сперанского. 2018. Т. 97, № 5. С. 118-130.
38. Verweij P.E., Rijnders B.J.A., Bruggemann R.J.M. et al. Review of influenza-associated pulmonary aspergillosis in ICU patients and proposal for a case definition: an expert opinion // Intensive Care Med. 2020. Vol. 46, N 8. P. 1524-1535. DOI: https://doi.org/10.1007/s00134-020-06091-6
39. White P.L., Dhillon R., Cordey A. et al. A national strategy to diagnose COVID-19 associated invasive fungal disease in the ICU // Clin. Infect. Dis. 2021. Vol. 73, N 7. P. e1634-e1644. DOI: https://doi.org/10.1093/cid/ciaa1298
40. Koehler P., Bassetti M., Chakrabarti A. et al. Defining and managing COVID-19-associated pulmonary aspergillosis: the 2020 ECMM/ISHAM consensus criteria for research and clinical guidance // Lancet Infect. Dis. 2021. Vol. 21, N 6. P. e149-e162. DOI: https://doi.org/10.1016/S1473-3099(20)30847-1
41. Donnelly J.P., Chen S.C., Kauffman C.A. et al. revision and update of the consensus definitions of invasive fungal disease from the European Organization for Research and Treatment of Cancer and the Mycoses Study Group Education and Research Consortium // Clin. Infect. Dis. 2020. Vol. 71, N 6. P. 1367-1376. DOI: https://doi.org/10.1093/cid/ciz1008
42. Guinea J., Bouza E. Current challenges in the microbiological diagnosis of invasive aspergillosis // Mycopathologia. 2014. Vol. 178, N 5-6. Р. 403-416. DOI: https://doi.org/10.1007/s11046-014-9763-3
43. Han Y., Wu X., Jiang G. et al. Bronchoalveolar lavage fluid polymerase chain reaction for invasive pulmonary aspergillosis among high-risk patients: a diagnostic meta-analysis // BMC Pulm. Med. 2023. Vol. 23, N 1. Р. 58. DOI: https://doi.org/10.1186/s12890-023-02343-5
44. Игнатьева С.М., Шадривова О.В., Шурпицкая О.А. и др. Определение галактоманнана Aspergillus spp. в БАЛ больных COVID-ассоциированным инвазивным аспергиллезом // Проблемы медицинской микологии. Т. 25, № 2. С. 115.
45. Bassetti M., Giacobbe D.R., Agvald-Ohman C. et al. Invasive Fungal Diseases in Adult Patients in Intensive Care Unit (FUNDICU): 2024 consensus definitions from ESGCIP, EFISG, ESICM, ECMM, MSGERC, ISAC, and ISHAM // Intensive Care Med. 2024. Vol. 50, N 4. Р. 502-515. DOI: https://doi.org/10.1007/s00134-024-07341-7
46. Wahidi M.M., Lamb C., Murgu S. et al. American Association for Bronchology and Interventional Pulmonology (AABIP) statement on the use of bronchoscopy and respiratory specimen collection in patients with suspected or confirmed COVID-19 infection // J. Bronchol. Interv. Pulmonol. 2020. Vol. 27, N 4. Р. e52-e54. DOI: https://doi.org/10.1097/LBR.0000000000000681
47. Alexander B.D., Lamoth F., Heussel C.P. et al. Guidance on imaging for invasive pulmonary aspergillosis and mucormycosis: from the Imaging Working Group for the Revision and Update of the Consensus Definitions of Fungal Disease from the EORTC/MSGERC // Clin. Infect. Dis. 2021. Vol. 72. Р. S79-S88. DOI: https://doi.org/10.1093/cid/ciaa1855
48. Alhan O., Saba R., Akalin E.H. et al. Diagnostic efficacy of Aspergillus galactomannan lateral flow assay in patients with hematological malignancies: a prospective multicenter study // Mycopathologia. 2023. Vol. 188, N 5. Р. 643-653. DOI: https://doi.org/10.1007/s11046-023-00749-7
49. Lee Y.R., Choi Y.W., Lee K.J. et al. CT halo sign: the spectrum of pulmonary diseases // Br. J. Radiol. 2005. Vol. 78, N 933. P. 862-865. DOI: https://doi.org/10.1259/bjr/77712845
50. Sevilha J.B., Rodrigues R.S., Barreto M.M. et al. Infectious and non-infectious diseases causing the air crescent sign: a state-of-the-art review // Lung. 2018. Vol. 196, N 1. P. 1-10. DOI: https://doi.org/10.1007/s00408-017-0069-3
51. Sinkó J., Csomor J., Nikolova R. et al. Invasive fungal disease in allogeneic hematopoietic stem cell transplant recipients: an autopsy-driven survey // Transpl. Infect. Dis. 2008. Vol. 10, N 2. Р. 106-109. DOI: https://doi.org/10.1111/j.1399-3062.2007.00264.x
52. Tarrand J.J., Lichterfeld M., Warraich I. et al. Diagnosis of invasive septate mold infections. A correlation of microbiological culture and histologic or cytologic examination // Am. J. Clin. Pathol. 2003. Vol. 119, N 6. Р. 854-858. DOI: https://doi.org/10.1309/EXBV-YAUP-ENBM-285Y
53. Hoenigl M., Prattes J., Spiess B. et al. Performance of galactomannan, beta-d-glucan, Aspergillus lateral-flow device, conventional culture, and PCR tests with bronchoalveolar lavage fluid for diagnosis of invasive pulmonary aspergillosis // J. Clin. Microbiol. 2014. Vol. 52, N 6. Р. 2039-2045. DOI: https://doi.org/10.1128/JCM.00467-14
54. Choi Y., Kim D., Choe K.W. et al. Performance evaluation of Bruker Biotyper, ASTA MicroIDSys, and VITEK-MS and three extraction methods for filamentous fungal identification in clinical laboratories // J. Clin. Microbiol. 2022. Vol. 60, N 11. Article ID e00812-22. DOI: https://doi.org/10.1128/jcm.00812-22
55. Salah H., Kolecka A., Rozaliyani A. et al. A new filter based cultivation approach for improving aspergillus identification using matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) // Mycopathologia. 2022. Vol. 187, N 1. Р. 39-52. DOI: https://doi.org/10.1007/s11046-021-00603-8
56. Zvezdanova M.E., Arroyo M.J., Méndez G. et al. Detection of azole resistance in Aspergillus fumigatus complex isolates using MALDI-TOF mass spectrometry // Clin. Microb. Infect. 2022. Vol. 28, N 2. Р. 260-266. DOI: https://doi.org/10.1016/j.cmi.2021.06.005
57. Lau A.F., Walchak R.C., Miller H.B. et al. Multicenter study demonstrates standardization requirements for mold identification by MALDI-TOF MS // Front. Microbiol. 2019. Vol. 10. Р. 2098. DOI: https://doi.org/10.3389/fmicb.2019.02098
58. Bassetti M., Zuccaro V., Asperges E. et al. Performance of existing definitions and tests for the diagnosis of invasive aspergillosis in critically ill, non-neutropenic, adult patients: an update including COVID-19 data // J. Infect. 2022. Vol. 85, N 5. Р. 573-607. DOI: https://doi.org/10.1016/j.jinf.2022.08.003
59. Mikulska M., Furfaro E., De Carolis E. et al. Use of Aspergillus fumigatus real-time PCR in bronchoalveolar lavage samples (BAL) for diagnosis of invasive aspergillosis, including azole-resistant cases, in high risk haematology patients: the need for a combined use with galactomannan // Med. Mycol. 2019. Vol. 57, N 8. Р. 987-996. DOI: https://doi.org/10.1093/mmy/myz002
60. Hage C.A., Carmona E.M., Epelbaum O. et al. Microbiological laboratory testing in the diagnosis of fungal infections in pulmonary and critical care practice. An official American Thoracic Society clinical practice guideline // Am. J. Respir. Crit. Care Med. 2019. Vol. 200, N 5. Р. 535-550. DOI: https://doi.org/10.1164/rccm.201906-1185ST
61. White P.L., Mengoli C., Bretagne S. et al. Evaluation of Aspergillus PCR protocols for testing serum specimens // J. Clin. Microbiol. 2011. Vol. 49, N 11. Р. 3842-3848. DOI: https://doi.org/10.1128/JCM.05316-11
62. Azar M.M., Gaston D.C., Kotton C.N. et al. Emerging microbiology diagnostics for transplant infections: on the cusp of a paradigm shift // Transplantation. 2020. Vol. 104, N 7. Р. 1358-1384. DOI: https://doi.org/10.1097/TP.0000000000003123
63. Cruciani M., Mengoli C., Loeffler J. et al. Polymerase chain reaction blood tests for the diagnosis of invasive aspergillosis in immunocompromised people // Cochrane Database Syst. Rev. 2019. Vol. 9, N 9. CD009551. DOI: https://doi.org/10.1002/14651858.CD009551.pub4
64. Eigl S., Hoenigl M., Spiess B. et al. Galactomannan testing and Aspergillus PCR in same-day bronchoalveolar lavage and blood samples for diagnosis of invasive aspergillosis // Med. 2017. Vol. 55, N 5. P. 528-534. DOI: https://doi.org/10.1093/mmy/myw102
65. Игнатьева С.М., Спиридонова В.А., Богомолова Т.С. и др. Апробация мультиплексной ПЦР-тест-системы ("HRM-ZYGO-ASP") у больных при инвазивном аспергиллезе // Проблемы медицинской микологии. Т. 22, № 3. С. 80.
66. Ao Z., Xu H., Li M. et al. Clinical characteristics, diagnosis, outcomes and lung microbiome analysis of invasive pulmonary aspergillosis in the community-acquired pneumonia patients // BMJ Open Respir. Res. 2023. Vol. 10. Article ID e001358. DOI: https://doi.org/10.1136/bmjresp-2022-001358
67. Zhan W., Liu Q., Yang C. et al. Evaluation of metagenomic next-generation sequencing diagnosis for invasive pulmonary aspergillosis in immunocompromised and immunocompetent patients // Mycoses. 2023. Vol. 66, N 4. Р. 331-337. DOI: https://doi.org/10.1111/myc.13557
68. Tsang C.C., Teng J.L.L., Lau S.K.P. et al. Rapid genomic diagnosis of fungal infections in the age of next-generation sequencing // J. Fungi (Basel). 2021. Vol. 7, N 8. Р. 636. DOI: https://doi.org/10.3390/jof7080636
69. Fang X., Mei Q., Fan X. et al. Diagnostic value of metagenomic next-generation sequencing for the detection of pathogens in bronchoalveolar lavage fluid in ventilator-associated pneumonia patients // Front. Microbiol. 2020. Vol. 11. Article ID 599756. DOI: https://doi.org/10.3389/fmicb.2020.599756
70. Zhang K., Yu C., Li Y. et al. Next-generation sequencing technology for detecting pulmonary fungal infection in bronchoalveolar lavage fluid of a patient with dermatomyositis: a case report and literature review // BMC Infect. Dis. 2020. Vol. 20, N 1. Р. 608. DOI: https://doi.org/10.1186/s12879-020-05341-8
71. Chen J., Zhao Y., Shang Y. et al. The clinical significance of simultaneous detection of pathogens from bronchoalveolar lavage fluid and blood samples by metagenomic next-generation sequencing in patients with severe pneumonia // J. Med. Microbiol. 2021. Vol. 70, N 1. DOI: https://doi.org/10.1099/jmm.0.001259

Материалы данного сайта распространяются на условиях лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License («Атрибуция - Всемирная»)